درجة الدكتوراه:
يحق لمن يحمل شهادة الماجستير فى التخصص أو مايعادلها وأتم التدريب الأساسي والتخصصي التقدم للحصول على درجة الدكتوراه وتكون مدة الدراسة للحصول على الدرجة 4 "أربعة" سنوات على الأقل بحد أقصى 8 سنوات وفى حالة حصول الطالب على ماجستير عام يسمح له بالقيد لدرجة الماجستير المتخصص ويقوم بأستكمال النقاط المعتمدة للمقررات الخاصة بدرجة الماجستير الممنوحة من المعهد قبل التسجيل لدرجة الدكتوراه.
ويخصص لدرجة الدكتوراه من 190 إلى 240 نقطة معتمدة وتشمل البرنامج التدريبي المتقدم بالإضافة إلى مقررات اكاديمية (عامه- وتخصصية) ورسالة بحثية ويتقدم بمشروع البحث خلال 12شهر من القيد لدرجة الدكتوراه ولايحق له التقدم للمناقشة إلا بعد مرور عامين كاملين من تاريخ موافقة مجلس المعهد على تسجيل البحث. ويخصص للرسالة 40نقطة معتمدة .
يحق للطالب التقدم لامتحان (مقررات الجزء الأول) بعد حضورها ومن يرسب فى مادة منهم يقوم باعادتها فقط.
يحق للطالب التقدم للإمتحان التحريري فى مقررات الجزء الثانى بعد مرور فترة سنتين على الأقل من تاريخ القيد. ويكون تقدم الطالب للامتحانات العملية والإكلينيكية والشفوية بعد اجتياز الامتحان التحريري وتكون نتيجة الامتحان التحريري سارية لمدة عامين (اربع أدوار امتحان متتالية) وفى حالة عدم اجتياز الامتحانات الإكلينيكية والشفوية (خلال سريان نتيجة الامتحان التحريري) – على الطالب التقدم مرة أخرى لإعادة الامتحان التحريري ولايحصل الطالب على شهادة الدكتوراه إلا بعد إتمام البرنامج التدريبي المتقدم واجتياز امتحانات مقررات الجزء الأول واجتياز اختبار شامل (نظرى – شفوى- عملى أو أكلينيكي) فى مقررات الجزء الثانى وإجازة الرسالة وأن يقدم الطالب ما يفيد .
نشر بحثين من موضوع الرسالة أحدهما فى (مجلة محلية ) والبحث الثاني فى (مجله دولية ) و هي مجله لها معامل تأثير (Impact Factor) صادر من (THOMSON- REUTERS) أو مجله متخصصه لها ناشر دولي معتمد من اتحاد الناشرين الدوليين او هي مجله اقليمية او مصريه متخصصه معتمدة من المجلس الاعلي للجامعات و تحصل علي تقييم 6 أو اكثر من لجنة الترقيات لهذا التخصص و متاحه علي الانترنت .
التدريب العملى والإكلينيكي:-
يعتبر التدريب جزء أساسى من الدرجة العلمية وله نقاط معتمدة وتقوم الأقسام المختصة بإعداد البرنامج التدريبي الخاص بها وتحديد النقاط المعتمدة لكل نشاط على حده ويتم تحديد الحد الأدنى والأعلى المسموح به فى كل نشاط لتحقيق المخرجات العملية التعليمية للبرامج الدراسية المختلفة.
ويقوم الطالب بتسجيل كل الأنشطة التدريبية الخاصة به فى كراسة التدريب التى يتم اعتمادها من رئيس القسم و مسئول التدريب بالقسم, ولايحق للطالب دخول الامتحان إلا بعد استيفاء الحد الأدنى من النقاط المعتمدة.
فترة التدريب 3 سنوات للماجستير تقسم على المراحل الآتية:
1- مرحلة التدريب الأساسي :- مدته سنه ويقوم كل قسم بتحديد فترة ونوعية التدريب المطلوب
فى الأقسام الإكلينيكية المختلفة مثل اقسام العناية المركزة والطوارئ والباطنة والجراحة العامه والأطفال.
2- مرحلة التدريب التخصصى :- مدته سنتان ويتم تحديدها من قبل الأقسام المتخصصة بالمعهد.
فترة التدريب 4سنوات للدكتوراه تقسم على المراحل الآتية:
1- مرحلة التدريب التخصصى :- مدته سنتان ويتم تحديدها من قبل الأقسام المتخصصة بالمعهد.
2- مرحلة التدريب المتقدم :- ومدته سنتان فى الأقسام التخصصية ويجوز للمتدرب أن يقضى
فترة 6( ستة ) أشهر فى الأقسام الأخرى يختارها الطالب وفقاً لما يحدده القسم التابع له وذلك بعد الحصول
على موافقة الأقسام المراد التدريب بها.
ويجوز القيام بجزء من التدريب الأساسي والتخصصي والمتقدم فى إحدى جامعات أو كليات أو معاهد علمية أو مستشفيات أخرى معتمدة من معهد جنوب مصر للأورام جامعة أسيوط داخل أو خارج مصر بعد موافقة القسم المعنى على اعتماد هذا التدريب.
الأنشطة العلمية:-
تعتبر المشاركة فى الأنشطة العلمية العامه بالمعهد ( حضور اليوم العلمى الاسبوعى للمعهد- المشاركة فى الندوات العلمية وحضور مناقشات الرسائل العلمية) والأنشطة العلمية الخاصة بالأقسام جزء أساسي من البرامج العلمية ويقوم الطالب بتسجيل كل الأنشطة فى كراسة الأنشطة وتعتمد من مجلس القسم و المسئول عن النشاط العلمى به ولايحق للطالب دخول الأمتحان إلا بعد استيفاء الحد الأدنى من النقاط المعتمدة فى جميع الأنشطة وتجدد هذه الموافقة سنوياً فى نهاية العام الدراسى.