رسالة القسم هى تقديم المعرفه لطلبة ما قبل التخرج ، وكذلك طلبة الدراسات العليا عن طبيعة وصفات وتركيب الانسجه الموجودة بمنطقة الفم والأسنان وما يحيط بالفم ، ودراسة خصائصها البيولوجيه وتشريحها النسيجى والخلوى ومعرفة وظيفة كل جزء من هذه الاجزاء ومدى ملائمته للقيام بهذه الوظيفه ، وذلك بهدف تخريج أطباء أسنان يملكون المعرفة والمهارات التى تحتاجها الحياه العملية والتى تمكنهم من أداء مهامهم على النحو الامثل . كما يهدف القسم الى تقديم كل جديد فى مجال بحوث الانسجه والخلايا مما يؤدى فى النهاية الى خدمة الإنسان والمجتمع فى مجال صحة الفم و الأسنان
يطمح قسم بيولوجيا الفم إلى أن يحقق مكانه متميزة بين الأقسام المماثلة فى كليات طب الأسنان على مستوى جمهورية مصر العربية ، وذلك من خلال الارتقاء بمستوى تعليم الطلاب . وكذلك يرنو القسم أن يحقق التقدم فى مجال الأبحاث العلمية التى ترقى إلى المكانة العلمية ، وتهدف إلى حجز مكانة وسط الدول المتقدمة